Zoek repositories

Overzicht van open source projecten van Nederlandse overheidsorganisaties.

Vind repositories

rivm ✕

Gearchiveerde repositories

Toon alleen gearchiveerde (0)

RIVM-bioinformatics / AmpliGone
Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu
A tool in order to accurately remove primer sequences from NGS reads in an amplicon experiment

python bioinformatics illumina nanopore ngs-analysis pcr rivm amplicon-sequencing

Python

5 dagen geleden bijgewerkt
RIVM-bioinformatics / ViroConstrictor
Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu
ViroConstrictor is a pipeline designed to process raw FastQ data from viral amplicon-based sequencing and generate biologically correct consensus sequences of the given viral genome

python analysis bioinformatics ngs-analysis rivm consensus-sequences public-health snakemake-workflow virology viruses snakemake

Python

6 dagen geleden bijgewerkt
RIVM-bioinformatics / SARS2seq
Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu
SARS2seq is a pipeline designed to process raw FastQ data from targeted SARS-CoV-2 sequencing and generate biologically correct consensus sequences of the SARS-CoV-2 genome.

python virology bioinformatics ngs-analysis rivm consensus-sequences coronavirus-analysis coronavirus public-health snakemake-workflow viruses snakemake

Python

4 maanden geleden bijgewerkt